Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP4AP20648 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP4AP20648 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP4AP20648 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP4AP20648 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms