Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMPD1P17405 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD1P17405 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD1P17405 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD1P17405 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms