Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN1P12814 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms