Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR2F1P10589 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms