Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRFP10586 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRFP10586 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms