Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms