Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VIL1P09327 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VIL1P09327 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIL1P09327 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms