Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD1O95696 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD1O95696 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD1O95696 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms