Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAPGEF3O95398 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms