Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms