Protein–RNA interactions for Protein: O43151

TET3, Methylcytosine dioxygenase TET3, humanhuman

Predictions only

Length 1,660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET3O43151 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TET3O43151 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TET3O43151 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TET3O43151 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TET3O43151 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TET3O43151 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TET3O43151 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TET3O43151 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TET3O43151 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms