Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF6O14896 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF6O14896 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF6O14896 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF6O14896 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms