Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMX2A2RU54 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms