Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIPSLA2A3N6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms