Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1Q9UJ41 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1Q9UJ41 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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