Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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