Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM53CQ9NYF3 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms