Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms