Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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