Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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UBXN4Q92575 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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UBXN4Q92575 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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