Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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