Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms