Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RYR3Q15413 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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