Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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