Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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RAB39AQ14964 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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RAB39AQ14964 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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RAB39AQ14964 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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RAB39AQ14964 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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RAB39AQ14964 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
RAB39AQ14964 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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