Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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