Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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