Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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