Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms