Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms