Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CHD3Q12873 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CHD3Q12873 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CHD3Q12873 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD3Q12873 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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