Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms