Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RNF39Q9H2S5 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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