Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms