Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZBED3Q96IU2 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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