Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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FXNQ16595 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FXNQ16595 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FXNQ16595 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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