Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CNGA3Q16281 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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CNGA3Q16281 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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CNGA3Q16281 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CNGA3Q16281 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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