Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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