Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MTMR3Q13615 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms