Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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