Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms