Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD1-203ENST00000409643 2901 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF543-201ENST00000321545 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00930-202ENST00000557075 1541 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AZI2-212ENST00000479665 4706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007741.1-201ENST00000623818 3495 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ADIPOQ-201ENST00000320741 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 HLA-T-206ENST00000429813 450 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL320P-201ENST00000484133 295 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA31.7-201ENST00000516287 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD52-218ENST00000545564 681 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL783P-201ENST00000577950 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4440-201ENST00000583986 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099849.1-201ENST00000603437 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091953.1-201ENST00000624775 296 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-9Q9BYP9 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms