Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms