Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms