Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms