Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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