Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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CDH18Q13634 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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