Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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