Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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