Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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